根管治疗和拔牙没有好坏之分，需根据患牙的具体情况进行选择。通常情况下，医生会尽量保留患牙。因为每一颗牙都很重要，牙齿可以维持正常的咀嚼功能和效率，并且对于美观和发音也较为重要。因此一旦牙齿出现问题，医生都先建议进行根管治疗。
若患牙缺损的范围太大，缺损太深，已经到了龈下，甚至接近牙槽骨。根管治疗后这颗患牙无法再进行冠修复，随时可能劈裂，这类情况下医生可能会建议拔除后再种牙。同时一旦智齿出现了龋坏、牙髓炎或根尖周炎，也建议进行拔除。因为智齿位于牙弓最底端，在智齿进行治疗时，需尽力张嘴，医生操作较为困难，且智齿的形态、根管系统较为复杂，变因较大，又给操作增加了难度。智齿经过根管治疗后，有可能会失败复发，所以一旦智齿出现以上情况，建议进行拔除。
