疱疹性咽峡炎的初期症状，主要是突然发热并伴有咽痛、咳嗽、厌食、呕吐、恶心、腹泻等症状。由于疱疹性咽峡炎，主要发生在儿童、婴幼儿，在婴幼儿时有可能会由于剧烈的咽痛，而出现流口水、哭闹、拒绝进食等。多数儿童存在低热或者中度程度的发热，但是部分儿童可能会出现高热，甚至出现高热惊厥，且由于咽痛比较明显可能会影响吞咽。
由于疱疹性咽峡炎主要是病毒感染引起，常见是柯萨奇A型病毒与肠道病毒71型。在治疗方面，没有绝对特异性的抗病毒治疗，通常是对症支持治疗，适当补液以及维生素，注意水电解质平衡，也要注意保持口腔的卫生，可以用淡盐水或者生理盐水漱口，婴幼儿可以擦拭口腔，预防进一步的感染。同时疱疹性咽峡炎有传染性，所以要注意隔离，以免引起交叉感染。
