扁桃体化脓时，比较快速、有效的治疗方法是选择有效的消炎药。由于引起化脓性扁桃体炎的细菌，多数是革兰氏阳性球菌，所以在抗生素的选择上应选择广谱、对致病菌敏感的抗生素，如阿莫西林，以及二代以上的头孢类药物，如头孢克洛、头孢克肟、头孢地尼等。如果是对青霉素或者头孢类过敏的患者，则可以选择莫西沙星、克拉霉素等。
同时最好配合中成药，进行清热消肿，如复方双花片、丹参酮胶囊、蓝芩口服液等。患者咽喉的局部也可以选择抗菌、消炎的含漱液，进行含漱。患者也应注意多休息、多饮水、避免劳累、避免受凉、注意保暖，饮食清淡，可以多吃富含维生素和纤维素的食物，并且避免烟、酒刺激，多吃半流质及流质食物，从而保持大便通畅。
