结膜吸允线虫到医院后当天就可以去除干净，在医院处理时一般使用表麻药，也就是地卡因或者利多卡因进行局部点眼，成虫或者虫体就可以从眼角爬出，如果不爬出，眼科医生直接可以用显微镊子将其夹出。结膜吸允线虫如果不能立刻去除干净，主要与个人不注意卫生以及宿主有关，结膜吸允线虫的主要寄生宿主是在狗和猫的结膜泪管里，只要注意卫生、消毒，以及注意宠物卫生，就可以彻底根治结膜吸允线虫。
结膜吸允线虫可以出现在眼睑皮下，引起眼睑肿胀、红、疼痛，如果虫体不能及时去除干净，可以摩擦角膜引起角膜损伤，甚至形成角膜的云翳瘢痕愈合。同时结膜吸允线虫也可以钻入眼球内，出现在前房，在前房内可以见到丝状体来回游走，这很危险，会造成眼内炎症，同时造成眼睛视力的急剧下降。
