坏死性溃疡性龈口炎的治疗原则是采用口腔局部治疗和抗生素抗感染治疗为主，支持治疗为辅；主要药物有头孢、甲硝唑及维生素C等，用过氧化氢溶液局部冲洗含漱。该病需要长期持续性治疗。
一、一般治疗
去除坏死组织，并初步去除大块的龈上结石，用过氧化氢溶液局部冲洗、含漱，目的是清洁口腔和消毒口腔。
二、药物治疗
1、头孢类药物：主要使用抗生素抗感染治疗。在临床上主要是可以口服头孢类的抗生素，如头孢哌酮、头孢他啶，来进行抗感染治疗，效果比较好。但抗生素必须要在明确有病菌感染的前提下才可以使用，不能盲目滥用。
2、甲硝唑：主要用于治疗或预防厌氧菌引起的系统或局部感染，口服或直肠给药后能迅速而完全地吸收。不良反应主要以消化道症状为主，包括恶心、呕吐、食欲不振、腹部绞痛，一般不影响治疗。有活动性中枢神经系统疾患和血液病者禁用。
3、维生素C：对于缺乏维生素C的患者，需要多补充维生素C，有助于减少牙龈出血。
4、漱口液：用含双氧水漱口液、康复新液含漱，改善口腔环境。
三、手术治疗
1、龈上洁治术：用洁治器械去除龈上牙石、菌斑和色渍，并磨光牙面，以延迟菌斑和牙石再沉积。
2、龈下刮治术：是用比较精细的龈下刮治器刮除位于牙周袋内根面上的牙石和菌斑。牙周炎的主要致病因素即附着在牙根表面形成的牙石和菌斑。通过龈下刮治术，也就是通俗所说的“深层洁牙”来去除深在的牙石菌斑。
3、根面平整术：根面平整术是牙周刮治的一种常规治疗，它是牙周刮治里必不可少的一部分。它的作用是把牙根表面的牙结石清除干净的情况下，把牙根表面被细菌腐蚀，或者牙根表面本身发育的不平的那一部分把做平整，牙根在以后不容易在上面形成细菌的堆积，不容易形成牙结石，也就更不容易形成牙周炎。
4、牙周手术：急性期若患者患有慢性牙周炎，经上述手术治疗后效果不好或者复发，可以行牙周手术，目的是彻底清除残留在深部的细菌，防止复发。手术方式有牙龈切除术、牙龈成形术、翻瓣术。