完全性肺静脉异位回流的主要治疗手段为手术治疗，可通过行根治术帮助患儿拥有正常的心功能，术后需常规应用正性肌力药物，通常短期持续治疗既可改善患者病情。
一、药物治疗
1、多巴酚丁胺：当患者存在肺动脉高压时，该药品能增强心肌收缩力，增加心排血量，但对心率的影响远小于异丙肾上腺素，较少引起心动过速。临床上对心肌梗死后或心脏外科手术时心排血量低的休克患者有较好疗效，优于异丙肾上腺素，较为安全，同时还可以用于心排血量低和心率慢的心力衰竭患者，其改善左心室功能的作用优于多巴胺，常见的不良反应为心悸、恶心、头痛﹑胸痛、气短等。
2、米力农：磷酸二酯酶抑制药，兼有正性肌力作用和血管扩张作用，用于多种原因引起的急性心力衰竭及慢性难治性心力衰竭的短期治疗，不良反应为室性心律失常、室上性心律失常、心房颤动、窦性心动过速、低血压、胸痛、低钾血症，轻至中度头痛头晕、震颤、恶心、呕吐、血小板减少。
3、曲美他嗪：该药品可以增加冠状动脉血流量及周围循环血流量，促进心肌代谢及心肌能量的产生。同时能减低心脏工作负荷。降低心肌耗氧量及心肌能量的消耗，从而改善心肌氧的供需平衡。
4、尼可地尔：本品系钾通道激活药，能选择性较强地扩张冠状动脉，增加冠状动脉血流量，且持续时间较长，对冠状动脉具有剂量依赖性的扩张作用，常见的不良反应为面部潮红、全身倦怠、下肢浮肿、体位性低血压等。
二、手术治疗
1、带囊导管扩大房间隔通道：该手术方式只可起到暂时缓解症状的效果，待患儿学龄前施行根治术。
2、根治术：将左房后壁与肺静脉总干相连接，使肺静脉总干静脉血回流至左心房。然后结扎无用静脉，修补房间隔缺损。