导致胚胎停育的原因，主要有以下几种情况：
一、胚胎染色体异常：是最常见的一种原因，尤其是早期的胚胎停止发育，经过检查发现，大约有50%-60%的胚胎有染色体的异常。如果夫妇任何一方有染色体异常，均可以传给子代，从而导致胚胎停止发育。
1、遗传因素：染色体异常又包括染色体的数目异常，包括三倍体及四倍体，还有结构异常，结构异常主要包括染色体的异位、断裂、缺失。
2、外界因素：外界的感染、药物等不良作用也容易导致胚胎染色体异常，从而出现胚胎停止发育。对于发生流产的患者，一般排出物会呈现为空孕囊或退化的胚胎。
二、母体的因素：
1、全身性感染、高热：可以引起子宫收缩，导致流产、胚胎停止发育。如果母体感染病毒、梅毒、支原体、衣原体、疱疹病毒等，均会引起胎儿染色体畸变，从而导致胚胎停止发育，并且出现流产的症状。
2、免疫功能的异常：比如出现母儿血型不合或孕妇的抗磷脂抗体产生过多等，也是导致胚胎、胎儿受到排斥，出现胚胎停育的原因。
3、子宫的异常：也有部分患者是由于子宫发育异常，比如子宫纵隔或子宫黏膜下肌瘤等，导致胚胎着床过程中发育不良，从而引起胚胎停止发育。
4、其他因素：环境因素或不良的习惯等，这些也是引起胚胎停止发育的原因。
