梅杰综合征的治疗方法包括口服药物、A型肉毒杆菌素局部注射、手术等。原则上一般对早期患者首先采取口服药物治疗，并可结合局部注射治疗；对病程较长、口服及局部注射治疗效果不佳、患者日常生活明显受到影响者，可考虑手术治疗，本病治疗一般属于长期持续性治疗。
一、一般治疗
1、去除诱因：了解存在的诱因并及时消除，如停服或减少抗精神类药品、抗帕金森药物；控制感染，避免感染加重病情。
2、并发症的治疗：如有结合关节紊乱给予手法复位；焦虑或抑郁患者给予抗焦虑或抗抑郁药物，辅助心理治疗。
二、药物治疗
1、多巴胺受体拮抗剂：如氟哌啶醇，氟哌啶醇可以治疗肌张力障碍，但需注意，氟哌啶醇达到有效剂量时，可能诱发轻度帕金森综合征。
2、γ氨基丁酸类药：如丙戊酸钠，丙戊酸钠是一种情绪稳定剂，对于情绪易波动、易激动的患者使用丙戊酸钠可以使患者的情绪平复，用丙戊酸钠的时候要注意肝肾功能的监测和血常规的监测。
3、抗胆碱能药：如苯海索，改善震颤，治疗畸形性肌张力障碍、癫痫、以及服用相关治疗慢性精神分裂症药物和抗精神病药物所致的静坐不能。不良反应有心动过速、口干、便秘、尿潴留、瞳孔散大、视力模糊等抗胆碱反应；大剂量可有中枢神经系统症状，如幻觉、谵妄、精神病样表现等。
4、安定类药：如地西泮，具有抗焦虑、镇静安眠、抗惊厥作用，也能解除肌肉痉挛。不良反应有嗜睡、头昏、乏力、大剂量可以导致共济失调、震颤，甚至危及生命。
5、抗抑郁药：如舍曲林，是一种强效的5-羟色胺再摄取抑制剂，治疗焦虑症、强迫症以及创伤后应激障碍。不良反应有腹泻、口干、消化不良和恶心、厌食、眩晕、嗜睡和震颤。
6、局部注射肉毒素或肉毒杆菌素：肉毒杆菌素是由肉毒杆菌在繁殖过程中所产生的一种神经毒素蛋白。局部注射的肉毒杆菌素可与突触前膜内胆碱能内膜蛋白结合，有效抑制钙离子内流而暂时阻断乙酰胆碱的释放，从而明显缓解肌肉麻痹以及局部肌肉的痉挛症状。肉毒杆菌素注射可以与口服药物同时进行，也可以在口服药物疗效不满意时选用。该方法对眼睑痉挛的疗效优于对口下颌肌张力障碍的疗效。
三、手术治疗
脑深部电刺激术是随着立体定向技术的发展应运而生的一种新型的治疗梅杰综合征的方法。对于口服和(或)注射药物疗效不满意或对药物不良反应不耐受，症状较重影响日常生活的患者，脑深部电刺激术是一个有益的治疗选择，具有微创、可逆、可调控、个性化等特征。是目前最佳治疗方式，术后患者可长期受益。