新生儿肺炎分为产前、产中、生产后感染导致的，病原菌感染可有细菌、病毒、衣原体、解脲脲原体、真菌、卡氏肺孢子虫肺炎、巨细胞病毒感染肺炎、呼吸道合胞病毒肺炎，但是临床及教科书中没有见过支原体感染性的新生儿肺炎，支原体感染性肺炎常见于学龄前、学龄期的儿童，新生儿未见过有支原体感染性肺炎。
新生儿常见的有衣原体感染性肺炎，衣原体感染性肺炎主要是孕妇的宫颈沙眼衣原体定植，新生儿在阴道分娩的过程中约70%可能传染给新生儿，其中5%-18%的新生儿发生包涵体性结膜炎，15%-20%发展为鼻咽部感染，10%-18%发生衣原体肺炎。
孕妇感染后未经治疗者早期破损，在低出生体重儿也有较高的发生率，并在生后5-14天少数可发生衣原体结合膜炎，多数在生后3-12周发病，起病缓慢，先有上呼吸道感染症状、气促、呼吸窘迫、喘憋、断续的咳嗽、无热、低热，肺部有哮鸣音、湿啰音，病程可达数周到一个月以上，X线表现成过度充气，以弥漫性网状颗粒影为主要表现，有时有肺膨胀不全及网状影。诊断可取鼻咽部、气管标本作为衣原体细胞的培养，直接荧光免疫法测定CT特异性抗体，治疗首选红霉素，红霉素耐药者可选用阿奇霉素，这主要是对衣原体感染性肺炎进行治疗。
