甲状旁腺功能减退患者需要终身治疗，甲状旁腺功能减退症的治疗视其轻重缓急而定，主要通过急诊治疗、药物治疗、手术治疗而达到缓解症状，提高并维持血清钙浓度在正常低限范围的目的。
一、急症治疗
急性甲状旁腺功能减退患者的血钙和甲状旁腺激素(PTH)水平迅速降低，会诱发急性症状。当患者出现手足搐搦、癫痫发作或心电图显示QT间期显著延长时，需要紧急治疗。对于成人，治疗首先是静脉给予葡萄糖酸钙溶静脉注射，之后静脉输注葡萄糖酸钙。
二、药物治疗
1、钙剂：对于病情稳定的慢性甲状旁腺功能减退成人，需要长期口服钙剂，钙剂常用的是碳酸钙。但中老年患者和胃酸缺乏者可能对其吸收不良，此时可用其他制剂，例如枸橼酸钙。
2、维生素D：维生素D常用的为骨化三醇，不同患者对维生素D的需求量有很大差异，正确的剂量主要是通过反复尝试来确定。
3、甲状旁腺激素替代治疗：鉴于甲状旁腺功能减退实际上是激素缺乏，补充所缺乏的激素，即甲状旁腺激素(1-84)或者甲状旁腺激素(1-34)可能是不错的治疗手段。对于慢性甲状旁腺功能减退患者，如果无法通过补充钙和维生素D来维持血清钙及尿钙水平稳定，则可选择加用重组人甲状旁腺激素(1-84)或者甲状旁腺激素(1-34)。
4、抗癫痫药物：常用的药物有丙戊酸钠、苯妥英钠、卡马西平，可以控制癫痫的发作。
5、噻嗪类利尿剂：常用药物为氯噻酮，此类药物可以减少钙经过尿液排泄，增加肾小管对钙的重吸收，提高血液中钙的浓度。
6、左甲状腺素(L-T)：治疗的目标是将血清TSH和甲状腺激素水平恢复到正常范围内，需要终身服药。治疗的剂量取决于病人的病情、年龄、体重和个体差异。
三、手术治疗
甲状旁腺移植术主要是将供体的甲状旁腺移植到甲状旁腺功能减退患者体内，由移植到体内的甲状旁腺分泌甲状旁腺激素，维持机体正常甲状旁腺激素水平，从而达到治疗目的。但是还存在供体来源、排异反应等诸多问题，因此尚在研究中，未应用于临床治疗。