雷贝拉唑和奥美拉唑的肠溶胶囊功效基本一致，但又有差别，从大的方面来说，适应症都是抑制胃酸分泌，针对十二指肠溃疡、胃溃疡、反流性食管炎等，都有很好的疗效，其中雷贝拉唑对胃手术后的吻合口溃疡有很好的抑制作用，而奥美拉唑的注射剂也有这个作用，两个药物都属于苯并咪唑类质子泵抑制剂，目前质子泵抑制剂已经发展到第三代，奥美拉唑属于第一代，雷贝拉唑属于第三代，两个药多作用于胃壁细胞的氢钾ATP酶，抑制胃酸分泌的最后的环节，减少了胃酸分泌，从而达到促进胃溃疡以及十二指肠溃疡面愈合的作用，但是雷贝拉唑是可逆性的质子泵抑制剂，在体外抗分泌的活性实验中，比奥美拉唑强2-10倍，而且雷贝拉唑具有更强的抗幽门螺杆菌活性的功能。
对于胃肠道的不良反应，奥美拉唑主要表现为头痛、恶心、腹泻、便秘和胀气，而雷贝拉唑的不良反应相对较少，主要表现为轻或是中度的不适、腹泻、恶心比较少见。从药理学上来看，由于奥美拉唑经过特殊的亚型肝脏药物代谢酶代谢，因此多种经过同意肝药酶代谢的药物，就会产生药物的相互作用，而雷贝拉唑主要经过非酶代谢，因此潜在的药物相互作用比较少。由于质子泵抑制剂都可以掩盖胃癌引起的症状，因此用药之前，应该排除恶性肿瘤的可能。
