雷贝拉唑和奥美拉唑都属于质子泵抑制剂，但两个药的效果还是有区别的。奥美拉唑属于第一代质子泵抑制剂，雷贝拉唑属于第三代质子泵抑制剂，它们的起效时间不同，雷贝拉唑口服吸收迅速，药物带多个酶位点，能5分钟左右起效，奥美拉唑要慢一些。
雷贝拉唑抑酸强度和持续抑酸时间都比奥美拉唑好，雷贝拉唑具有高选择性，且毒性低，不良反应发生率比奥美拉唑要少。此外，雷贝拉唑与其他药物的相互作用明显少于奥美拉唑，例如奥美拉唑与氯吡格雷合用时，奥美拉唑会影响氯吡格雷的代谢，进而降低其疗效，需要用雷贝拉唑替代奥美拉唑。