病情较轻无并发症的皮损，以局部治疗为主，皮损广泛、有全身感染并发症应口服抗生素。一般抗生素治疗一周有效、如果治疗效果较差，可使用万古霉素来治疗。
一、一般治疗
黄水疮患者注意个人卫生，保持皮肤清洁。患者要适当隔离，患者接触过的衣服、毛巾及用具等，应予消毒。应加强眼、口腔、外阴的护理，注意保持创面干燥。
二、急症治疗
黄水疮一般是属于发病较急、具有传染性的皮肤疾病，出现疾病的症状之后，一定要及时就诊治疗。
三、药物治疗
1、莫匹罗星软膏：莫匹罗星软膏适用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染，也就是黄水疮，一般是局部用药治疗。偶见局部烧灼感、蛰刺感及瘙痒，偶见过敏反应。哺乳期妇女涂药时应防止药物进入婴儿眼内，如果是在乳头区域使用，请在哺乳前彻底清洗。
2、夫西地酸乳膏：夫西地酸乳膏适应症为各种细菌性皮肤感染，主用于革兰式阳性球菌引起的皮肤感染，也就是黄水疮。一般无副反应，偶尔会有轻微的刺激感，对腿部深度溃疡的治疗会伴有疼痛，但通常无需停药，罕见过敏反应。夫西地酸对眼结膜有刺激作用，尽量避免在眼睛周围使用。
3、复方多粘菌素B软膏：复方多粘菌素B软膏用于预防皮肤创面的细菌感染及暂时缓解疼痛等不适症状，偶见过敏反应、搔痒、烧灼感、红肿等。避免在大面积烧伤面、肉芽组织或表皮脱落的巨大创面使用。当患者有肾功能减退或全身应用其它肾毒性或耳毒性药物时，应注意有产生毒性的可能。患者如有血尿、排尿次数减少、尿量减少或增多等肾毒性症状或耳鸣、听力减退等耳毒性症状时应慎用。
4、半合成青霉素：半合成青霉素是用于全身的药物，天然青霉素存在有抗菌谱窄、不耐胃酸口服无效及不耐酶易被水解等缺点，通过改变天然青霉素G的侧链可获得耐酸、耐酶、广谱、抗铜绿假单胞菌的半合成青霉素。
5、头孢菌素：头孢菌素可破坏细菌的细胞壁，并在繁殖期杀菌。对细菌的选择作用强，而对人几乎没有毒性，具有抗菌谱广、抗菌作用强、耐青霉素酶、过敏反应较青霉素类少见的优点。所以是一类高效、低毒、临床广泛应用的重要抗生素。过敏反应是最常见的不良反应，常见皮疹、荨麻疹、药疹和嗜酸性白细胞增多等，偶尔发生过敏性休克。
6、克林霉素：一般青霉素过敏者可选用克林霉素。克林霉素为抗生素类药，临床上可以用于金黄色葡萄球菌引起的黄水疮。可引起胃肠道反应例如恶心、呕吐、食欲不振、腹胀、腹泻、皮疹、白细胞减少、转氨酶升高、可引起二重感染，也可有呼吸困难，嘴唇肿胀，鼻腔肿胀，流泪和过敏反应。
7、万古霉素：如果7天内临床效果不明显，可选万古霉素。万古霉素有极强的杀菌作用，可作用于各种病原体引起的感染。可出现皮疹、恶心、静脉炎，也可引致耳鸣、听力减退，肾功能损害。个别患者尚可发生一过性周围血象白细胞降低、血清氨基转移酶升高等。快速注射可出现类过敏反应血压降低，甚至心跳骤停，以及喘鸣、呼吸困难、皮疹、上部躯体发红、胸背部肌肉痉挛。
四、手术治疗
该病无需手术治疗。
五、中医治疗
1、中成药外用：
（1）硫磺软膏：具有清热解毒、消肿散结的功效，可引起接触性皮炎，高浓度时对皮肤有刺激。
（2）黄连素片：具有清热解毒、消肿散结的功效，治疗时将本品溶于水中，进行洗浴或湿敷。
（3）冰硼散：具有清热解毒、消肿止痛的功效。
（4）复方片仔癀软膏：具有清热解毒、消肿止痛的功效，孕妇忌用。
2、中药外用：可用复方紫草油、三黄膏或加味青黛散外敷。