外耳道疖肿的治疗原则是合理局部用药，适时切开排脓，重视全身应用抗生素和支持疗法。本病患者多在医生指导下口服抗生素，局部清洗并外敷药液药膏。疖肿大者在医生的评估下可切开排脓，伴有糖尿病等慢性病的患者同时也应积极治疗基础病。
一、药物治疗
1、外耳道甚至整个耳廓应用5％酒精或4％硼酸酒精清洗干净。
2、疖肿初期，传统的局部用药是2％~5％酚甘油，涂布局部，此药对组织刺激性较大，效果不佳。目前多用5％~10％鱼石脂甘油滴耳，每日3次。也可用蘸有此药的纱条填入外耳道，每日更换1~2次。鱼石脂有轻度抑菌及刺激作用，可促进局部血液循环，以使炎症吸收。也有用2％~5％白降汞软膏涂于局部，此药更适于外耳道口的疖肿，因疖肿深在者，不易涂布。
3、若炎症累及耳廓周围，也可涂用鱼石脂软膏。渗出严重者可用4％醋酸铝湿敷。
4、较严重的疖肿应全身应用抗生素。早期应用者可免于化脓，若化脓后就医者，应在切开的同时全身应用抗生素，可首选青霉素或链霉素，待脓液培养并药敏试验以后，酌情调换。
二、手术治疗
本疗法仅用于脓肿成熟期。
1、小的疖肿可用蘸有50％石炭酸液的手术刀尖挑破脓头，大的疖肿可在局麻下用小刀切开排脓，刀口必须与外耳长轴平行，以防形成外耳道瘢痕性狭窄。
2、用棉签将脓液轻轻擦出，以3％双氧水擦洗，最后涂以红霉素软膏或撒布磺胺粉，松填以油纱条，利于脓液引流，但必须于24小时内更换。
3、脓液消失以后，经常用4％硼酸酒精清洗。脓肿未成熟者，严忌切开，以防炎症扩散。对于耳后脓肿也须切开排脓引流。
三、物理治疗
疖肿初期可配合物理疗法，如红外线、紫外线等，疼痛严重时可给止痛剂或镇静剂。
四、其他治疗
对糖尿病患者，应给予相应的治疗。若病人同时患全身多发性疖肿，要注意消除全身存在的金黄色葡萄球菌，如日光浴、经常用药皂洗澡、紫外线光浴等，加强营养、增强机体抵抗力也非常重要。