儿童遗尿症的治疗原则主要是对症治疗，包括药物治疗，功能锻炼，以及手术治疗，治疗效果良好，大部分患者可治愈，极小部分患儿持续到成年。
一、药物治疗
1、丙咪嗪：适用于觉醒障碍的儿童遗尿症，用于对其他药物治疗均无效的大龄患儿。治疗剂量为睡前单次给药，与M受体拮抗剂联用可以提高治疗效果，其最严重但是罕见的并发症有心脏毒性和肝毒性，开始使用之前应检查心电图是否有心律失常。
2、奥昔布宁：适用于昼夜尿频的儿童遗尿症，适用于排尿日记提示膀胱容量小或尿动力学检查提示有逼尿肌过度活动患儿。使用时要参照儿童剂量使用，每个疗程需3~6个月，注意口干和便秘等不良反应。
3、去氨加压素：是一种人工合成的抗利尿激素，适用于夜间多尿的儿童遗尿症，—般用于6岁或以上患者。治疗治愈率为30%，部分有效率为40%。停药后复发率较遗尿警铃高。停药时逐渐减药可以降低复发概率。其有效时间约8小时，常见不良反应包括头疼、恶心、呕吐等。
4、三联药物：联合应用阿米替林、去氨加压素和奥昔布宁是目前认为治疗顽固性混合表现遗尿症有效的三联药物。优点是有效率与下述的SNM疗法接近，缺点是有不同程度的副作用，并且停药后易复发。以上药物属于处方用药，丙咪嗪和阿米替林为抗抑郁症药，所示剂量为成人用量，小儿应以每公斤体重进行计算。
5、抗生素：根据尿液培养和药物敏感试验结果选用敏感抗生素治疗泌尿系统感染。
二、手术治疗
1、手术治疗主要是矫正引起儿童遗尿症的先天性疾病，重建正常的排尿结构，从而为儿童遗尿症的行为疗法创造条件。对男孩包茎、包皮口狭窄等只要没有泌尿系统感染可以通过包皮环切术解除。对男孩尿道下裂、女孩阴唇融合异位输尿管开口等病变都是泌尿外科手术指针，只要患儿没有感染，没有心肺功能障碍，通过泌尿外科手术重建正常的排尿结构。
2、对女孩尿道阴道瘘只要患儿可以耐受麻醉，就可以通过尿道阴道瘘修补术恢复正常的排尿结构。
3、隐性脊柱裂导致的继发性遗尿，只要患儿可以耐受全麻，就可以通过脊柱外科手术治疗修补脊柱裂。
三、其他治疗
1、排尿中断训练：鼓励孩子在每次排尿中间中断排尿，自己从1数到10，然后再把尿排尽，这样能训练并提高膀胱括约肌控制排尿的能力。
2、忍尿训练：白天让孩子多饮水，当有尿意时，让他忍住尿，每次忍尿不超过10分钟，每天训练1~2次，使膀胱扩张，增加容量，从而减少夜间排尿的次数。
3、觉醒训练：在以往晚间经常尿床的时间提前半小时用闹钟结合人为叫醒，让其在室内来回走动，或者用冷水洗脸，使在神志清醒状态下把尿排尽，目的也是有助于建立条件反射。