肺心病的治疗主要还是原发病的治疗，以及对出现肺心病后相关的心脏失代偿期要进行对症的处理。在肺、心功能代偿期的时候还是尽可能采用中西医结合的综合措施，增强患者的免疫功能以延缓肺胸疾病的进展。
另外去除急性发作的诱发因素，比如COPD的患者要尽量避免感冒、肺部感染，一旦进入肺心功能失代偿期，治疗原则就是积极控制感染、保持气道通畅、改善呼吸功能、纠正缺氧及二氧化碳潴留，比如呼吸衰竭的治疗。如果有感染应该给予积极的抗感染治疗，同时给予扩张支气管、去痰、纠正缺氧，随后纠正二氧化碳潴留的情况。如果出现呼吸衰竭，需要呼吸机辅助通气要积极的处理。
右心功能衰竭到后期会出现明显的浮肿，继而引发左心功能也不好，要积极的给予纠正心衰的治疗，比如给予利尿剂，常用的就是髓袢利尿剂，比如呋塞米、托拉塞米等。强心药常用洋地黄类，如西地兰、地高辛等，血管扩张剂可以扩张血管、减轻回心血量、减轻心脏负担，比如硝酸酯类静脉点滴。
对于一些并发症的处理，如果病人后期出现了肺性脑病还是应该积极的给予通气治疗，要纠正酸碱失衡、电解质紊乱，有心律失常的患者，如果很容易出现房颤也要给予积极控制心室率的治疗，必要的时候给予抗血栓、抗凝的治疗。
