糖皮质激素对免疫过程多个环节有抑制作用。小剂量糖皮质激素主要是抑制细胞免疫，大剂量则能够抑制由B细胞转化为浆细胞的过程，减少抗体生成，干扰细胞免疫。
糖皮质激素抑制免疫的机制是诱导淋巴细胞DNA降解，另外也可以影响淋巴细胞的物质代谢，同时诱导淋巴细胞凋亡，也可以抑制核转录因子NF-kB的活性，从而发挥免疫抑制作用。我们利用糖皮质激素抑制免疫的作用，来治疗各种自身免疫性的疾病，同时在移植免疫方面也有非常重要的作用。另外，糖皮质激素还有非特异性的抗炎作用，辅助抑制免疫。
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