虽然基于不同的心理治疗理论的目标、方法等有所不同，但实际操作的基本过程大致相同，包括初期、中期和后期阶段。
1、初期阶段：初期的主要任务是建立治疗关系、收集信息、评估和确认问题及制定治疗方案。实施治疗的一个先决条件是激发病人的动机与治疗者建立相互信任的治疗关系。帮助病人认识到自己是治疗过程的积极参与者，有责任提供信息并完成治疗期间的作业与练习，以及共同来思考合适的治疗目标。
2、中期阶段：中期阶段通常在心理治疗中占的时间最长。治疗者的主要任务是依据治疗方案，采取适宜的治疗措施帮助病人解决心理问题，达到预期的治疗目标。所谓适宜的治疗措施，是指针对目标行为的、病人需要的并能接受的，治疗者能熟练使用的措施。
3、结束阶段：治疗的最后阶段是处理结束治疗所产生的问题并帮助病人迁移和巩固治疗的效果。虽然，我们强调病人做自己的治疗师，但随着治疗即将结束，病人可能还会怀疑自己能否独立前行。而且病人还会因治疗结束要与治疗者分离而感到难过、害怕，治疗者也可能出现分离性焦虑。
