马拉色菌毛囊炎的治疗方法包括药物治疗、中医治疗、物理治疗等。
一、药物治疗
1、氟康唑：不良反应有胃肠道反应、皮损、肝功能异常、低钾、白细胞减少等。肝肾肝功能不良者慎用。注意遵医嘱适量服用，过量可伴随幻觉和偏执行为，如有猜疑、牵连观念、关系妄想或被害妄想，伴有幻觉的关系妄想或被害妄想等。
2、伊曲康唑：不良反应主要有恶心、头痛、胃肠道不适、转氨酶升高等。肝肾功能不良者慎用。
3、酮康唑霜：外用药，常见红斑、灼伤、瘙痒、刺痛或其他刺激症状。对本品过敏、病毒性感染、小儿、孕妇及哺乳期妇女禁用。
4、2%酮康唑洗剂：外用药，不良反应有用药局部烧灼感、瘙痒、刺激、油腻或干燥等。
5、2.5%二硫化硒：外用，偶可引起接触性皮炎，有不良反应时及时咨询医生。
二、中医治疗
中医通过内服加味枇杷清肺饮颗粒剂，外用皮肤康洗液、冰黄肤乐软膏、金银花、冯氏壮药外洗方、复方蛇床子酊等也取得了一定的治疗效果，中西医结合也有一定的疗效。
三、物理治疗
光动力疗法、窄普紫外线联合药物治疗也有不错的治疗效果。
