适当服用益生菌制剂可以调节肠道菌群，缓解因肠道菌群失调而导致的消化不良、腹泻、便秘等症状。正常人体如果长期服用益生菌制剂，可能会导致胃肠功能有所衰退，如果出现肠道菌群失调的情况，建议及时到医院就诊。
适量服用益生制剂菌对人体无害，也不会加重肝、肾脏的负担，但如果正常人体长期服用益生菌制剂，容易导致肠道菌群功能退化，从而导致肠道功能有所衰退，使人体日后长期依赖于益生菌制剂，一旦不服用，可能造成胃肠功能无法正常发挥的情况，所以不建议人体长期服用。
人体的消化系统较为复杂，同时也具备强大的自我修复能力，当肠道菌群失调时，可以短期食用益生菌使肠道菌群恢复正常，长期还是靠人体去正常菌群去应对。
肠道菌群失调的患者应注意饮食，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、洋葱、烟酒等，如果肠道菌群失调较为严重，可以在医生指导下使用枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌四联活菌片等药物进行治疗。
