0.01%的阿托品滴眼剂治疗近视的副作用，主要是在散瞳以后近处的物体看不清楚，而且会有怕光的情况，还有少数患者对阿托品过敏。目前阿托品是青少年近视检查和治疗的主要药物，1%的阿托品凝胶和0.01%的阿托品滴眼剂是常用的阿托品制剂。1%的阿托品凝胶主要适用于眼部的检查，也就是青少年近视检查前需要进行散瞳，点药后使得青少年的瞳孔充分散大，散大三周，这三周内看近看不清楚，还会比较害怕眼睛进入光线。
0.01%的阿托品作用比较弱，多数在晚上、早晨时会有瞳孔散大，睫状肌的麻痹作用消失。但阿托品本身也是有某些药物的副作用，包括脸部发红、眼睛发红、口干等，这些症状与阿托品本身的药物治疗有一定的关系。有些人对阿托品产生过敏，可能会有眼睛痒、眼睛红、产生眼袋等，而且使用阿托品瞳孔散大，还要进行眼压监测，以防止眼压升高。
