治疗贲门失弛缓症的措施，包括药物治疗、内镜下治疗、外科手术治疗等，都是以降低食管下括约肌高张力为目的，但没有任何方法可以改善食管的蠕动。贲门失弛缓症是一种慢性、非治愈性的疾病，治疗目标是缓解症状，改善食物排空，预防食管进一步地扩张。
1、可进行气囊扩张，气囊扩张是治疗贲门失弛缓症的一线方法。通过扩张而撕裂内环肌层，降低食管下括约肌的张力，从而缓解症状。
2、可以注射肉毒杆菌毒素，肉毒杆菌毒素可以抑制神经末梢的乙酰胆碱释放，从而抑制肌肉收缩。用于临时缓解症状，以及有气囊扩张及切开术治疗禁忌者。
3、可以进行药物治疗，常用的药物有硝酸酯类、钙通道阻滞剂以及促使食管下括约肌松弛的药物。都可以诱导食管下括约肌松弛，减少食管蠕动性收缩幅度作用。
另外，还可以进行手术治疗。
