真菌性尿路感染的常见致病菌，首先是白色念珠菌，其次是热带念珠菌和光滑念珠菌。

对于这种真菌性尿路感染的诊断，首先患者往往是存在其他并发的问题，比如长期应用抗菌药物、糖尿病先天畸形、神经源性膀胱、内置导管、回肠膀胱术外引流管，以及应用了免疫抑制剂等。

其次就是临床症状，这种真菌性尿路感染可以表现为无症状，这种情况往往提示是念珠菌或者其他真菌在尿路的定植，而不是感染。如果是造瘘口出现的念珠菌感染，会出现有皮肤红斑或者脓疱。如果发生了排尿的刺激症状或者脓尿，就提示有侵入性感染。肾或者肾周脓肿，真菌球可以由真菌尿引起来，这种患者可以表现出肾盂肾炎的腰痛，发热症状。对于念珠菌或者其他真菌所引起来的尿路感染，主要的靶器官是肾脏，因此患者表现是急性肾盂肾炎的症状，有的时候甚至还可以并发输尿管的梗阻。

还有就是进行实验室检查，对于真菌尿路感染的诊断，主要是靠尿液真菌涂片以及尿液的真菌培养。但是这种情况的标本比较容易被污染，通过念珠菌肌动蛋白基因进行pcr扩增，使真菌性尿路感染的诊断敏感性和特异性提高，能够达到100%，能对危重患者的真菌性尿路感染，甚至并发的真菌血症，进行有效的检测。同时危重症患者如果发生真菌感染，应当考虑是侵袭性的真菌感染，应当重复进行尿常规检查以及清洁中段尿，或者经耻骨上膀胱穿刺抽吸尿液来进行培养。

最后就是影像学检查，超声检查是排除肾脏和泌尿系统真菌感染的首选检查方法，B超和CT检查可以发现集合系统的真菌物质，并对尿路梗阻进行评估，CT能更好地辨别肾脏合并疾病或者肾周的脓肿。