衣原体的种类不同，感染的途径有所区别，临床比较常见的衣原体感染包括以下几类：
1、肺炎支原体感染：肺炎支原体通常是通过呼吸道飞沫传播，患者和隐性的感染者是肺炎衣原体的传染源，可以通过患者打喷嚏，大声说话，咳嗽引起的呼吸道飞沫吸入而感染，可以引起上呼吸道的感染，也可以引起下呼吸道的衣原体的感染。
2、沙眼衣原体感染：沙眼衣原体属于一种性传播疾病的病原，通常可以通过性接触传播，患者的阴道分泌物可以含有沙眼衣原体，可以引起泌尿生殖道的感染。如果接触了阴道的分泌物，用手触摸眼结膜也可以引起沙眼衣原体结膜的炎症导致沙眼。
3、鹦鹉热衣原体感染：主要是通过饲养一些鹦鹉、各种鸟类或者通过野生鸟类接触以后引起的感染。通常是通过吸入鸟类的粪便以及尿液等分泌物污染的空气中的尘埃而引起感染。
