睡觉醒来失忆几十秒钟，可能是生理性原因，也有可能是病理性原因：
1、生理性原因：睡觉醒来失忆几十秒钟有可能是由于大脑还处于睡眠状态，清醒得不完全，一部分大脑清醒过来了，但是还有一部分大脑处在睡眠抑制的状态，感觉就是睡眠虽然醒来了，但是仍失忆了几十秒钟。
2、病理性原因：睡觉起来失忆几十秒钟，还有可能是一些病理因素造成，首先就是特殊类型的癫痫，如失神发作，该疾病是一种癫痫小发作，可发育于任何年龄，儿童发病率是比较高的，会出现一过性的短暂的意识丧失、发呆、发愣的情况。睡觉醒来失忆几十秒钟，还有可能是短暂性脑缺血发作形成的，如果是偶尔出现醒来突然失忆几十秒钟，不需要过于在意，但是如果这种情况频繁出现，就应当及时到医院就诊，明确病因来对症治疗。
