HPV低危6型阳性一般可能会引起外阴、肛周、女性阴道壁、宫颈与男性龟头等部位发生湿疣样的改变，即尖锐湿疣。如果HPV低危6型阳性引起湿疣样的改变，需要予以治疗，如果未发生湿疣样病变，仅仅是存在局部感染，可以观察暂不用治疗。
1、需要治疗的情况：如果患者检查发现HPV低危6型阳性，外阴、阴道、肛周或者男性龟头处长出尖锐湿疣，则需要治疗。可以遵医嘱外用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏等进行治疗。还可以用激光烧灼的方法，或直接切除的办法把湿疣样的病变切掉；
2、不需要治疗的情况：如果患者感染HPV低危6型后，未发生湿疣样改变，可以通过随访与观察，一般不需要治疗。
另外，患者在治疗后需要切断传染源，进行性生活时需要佩戴避孕套，尽量避免再次感染HPV。如果患者出现反复发作的情况，可能是由于持续接触低危型HPV导致。
