肝癌并不都是乙肝引起，但与乙肝病毒感染有密切关系。同时还可与黄曲霉毒素、肝纤维化、长期接触化学物质，如亚硝胺类、氯乙烯、苯酚、肝血吸虫感染、吸烟等因素均有一定关系。

1、病毒性肝炎：乙肝病毒是肝癌病人的主要病因，乙肝病毒DNA序列和数组细胞的基因序列同时遭到破坏，或发生重叠整合，使癌基因激活和抑癌基因失活，从而发生细胞癌变；

2、黄曲霉毒素：流行病学研究发现，粮食受到黄曲霉毒素污染严重的地区，肝癌发病率高，而黄曲霉毒素的代谢产物之一，黄曲霉毒素B1能通过影响RAS、P53等基因的表达，而引起肝癌的发生；

3、肝纤维化：常见的有病毒性肝炎，酒精性肝病，非酒精性脂肪肝后肝硬化等原因导致的肝硬化，是引起肝癌发生的重要危险因素；

4、其他高危因素：如长期接触氯乙烯、亚硝胺类、苯酚等化学物质，同时若长期接触血吸虫、香烟中的尼古丁亚硝胺等，都是导致肝癌的风险因素，以上病因在肝细胞受损后的再生修复过程中，其生物学特征逐渐变化，基因突变，增殖与凋亡失衡，各种致癌因素也可促使癌基因表达及抑癌基因受抑，慢性炎症和纤维化过程中的活跃血管增殖，为肝癌的发生发展创造了重要条件。