通常情况下，长胎心、胎芽的时候不会流褐色分泌物。如果长胎心、胎芽时流褐色分泌物，可能与先兆流产、宫颈炎症、宫颈柱状上皮异位、宫颈息肉等异常情况有关，建议孕妇及时就医，在医生指导下进行针对性治疗。

正常情况下，在停经35日也就是5周左右，通过超声会在宫腔内见到圆形或椭圆形的妊娠囊，妊娠6周时会见到胚芽和原始心管搏动，即出现胎心、胎芽。通常长胎心、胎芽的时候，孕妇阴道分泌物主要呈白色或者处于无色透明状态，而且没有异味或略带有腥味，不会流褐色分泌物。此外，由于雌激素水平的升高，宫颈和阴道分泌物会明显增多。

而流褐色分泌物通常代表孕妇有少量阴道流血的情况，由于出血量较少不能及时流出来，分泌物在阴道积聚时间比较长，就会氧化使颜色加深，变成褐色。此时为一种异常情况，考虑与先兆流产、宫颈炎症、宫颈柱状上皮异位、宫颈息肉等情况有关。

如果长胎心、胎芽时流褐色分泌物，需及时到医院产科就诊，在医生指导下进行B超，以及HCG、孕酮的检查，明确原因后进行针对性治疗，如先兆流产可遵医嘱服用黄体酮胶囊保胎，妇科炎症可遵医嘱使用克霉唑栓治疗。