1、血常规：可发现白蛋白水平下降，白细胞、血尿素氮、肌酐、血清转铁蛋白水平升高，粪便菌群失调及粪便白细胞等。
2、影像学检查：腹部X线片可见麻痹性肠梗阻及“拇指纹”症，CT显示艰难梭菌腹泻患者的结肠壁增厚。
3、组织病理学检查：可见结肠特征性改变。即散在黄色或白色椭圆形斑块，边界清楚，与黏膜粘连牢固，冲洗不易脱落。斑块中央出现点状灰白色或棕褐色伪膜，周围常绕以红晕。病灶间黏膜常无明显炎症，重者可融合成片甚至成管型。
4、病原学检查：如粪便常规、粪便培养，肉眼观察粪便的外形、量、稠度及有无食物残渣、黏液、脓血等。不同细菌感染后粪便可呈稀水样便、洗肉水样便、脓血便、血便、黏液便等性状，确诊有赖于粪便病原菌的分离培养。
