肛门和阴囊瘙痒而且有裂纹，一般考虑与阴囊湿疹、肛裂、尖锐湿疣等因素有关，具体情况需要根据临床表现和检查结果来确诊，进行相应的治疗。
1、阴囊湿疹：主要由于不良生活习惯、出汗较多、不注意清洁卫生所引起，会使阴囊以及周围皮肤瘙痒、红肿，由于皮肤出现硬结，情况严重的会使皮肤产生裂纹，从而出现肛门和阴囊瘙痒而且有裂纹的表现。可以在医生的指导下外用糖皮质激素霜剂及口服氯雷他定、硫唑嘌呤等药物进行治疗；
2、肛裂：由于长期便秘、大便干燥导致肛门以及周围的组织出现机械性损伤，主要表现为肛门出现疼痛或出血现象，引起肛门和阴囊瘙痒而且有裂纹。可以通过局部涂抹利多卡因凝胶等镇痛药物来治疗，情况严重的患者可以采用肛裂切除术、侧位内括约肌切断术等方法进行治疗；
3、尖锐湿疣：由于不洁的性行为导致人乳头瘤病毒感染，累及阴囊、肛周皮肤，刺激局部皮肤，从而出现肛门和阴囊瘙痒而且有裂纹的表现，同时会出现红色疣体，常伴有异物感、刺痒等症状。可以在医生的指导下使用氟尿嘧啶乳膏、鬼臼毒素等来治疗，也可进行激光、液氮冷冻等方式进行治疗，并局部涂抹重组人干扰素α2b凝胶，以预防复发。
导致肛门和阴囊瘙痒而且有裂纹的病因较多，具体情况需要在正规医院进行检查，然后积极治疗。日常生活中应该养成良好的卫生习惯，对于预防此类情况都有一定的作用。