肠炎是一种笼统的说法，根据不同肠炎需要采取不同的治疗措施：
一、细菌感染性的肠炎，主要是进食不洁的食物后导致肠道的细菌繁殖，引起肠黏膜的充血水肿以及肠蠕动的加快，对于此类的肠炎可用口服，或静脉输注左氧氟沙星合并甲硝唑的方式来治疗，必须补充水电解质，以免发生脱水和电解质紊乱。
二、放射性肠炎，主要由于肿瘤行放射性治疗后，发生肠道上皮的充血水肿和肠壁的纤维化，对于此类的肠炎其无明显特效的治疗，主要是注意饮食以及可适量服用益生菌，如双歧杆菌三联胶囊、藿香正气液等，并可定期口服导泻的药物，如麻油、果导、番茄叶等。
三、炎性的肠病，如克罗恩病溃疡性结肠炎，属于自身免疫性肠炎。一般明显的药物难以治愈，只可以用免疫抑制剂来控制症状，以及延缓病情发展。
