指甲黑色素瘤首先可以通过手术的方式进行治疗。当黑色素病变在5cm以内，并且肿瘤厚度和嵌入深度小于1cm时，可以进行手术切除。
其次，也可以通过放射治疗，放射治疗适用于有转移灶的患者和早期雀斑型恶性黑色素瘤有效，可以缓解症状，比如疼痛、压迫等感觉。化学治疗及化疗对黑色素的疗效并不理想，据有关资料显示，治愈率不到10%，况且化疗药物有严重的毒副作用，使用后患者常有恶心、呕吐、食欲不振等现象。
最后可以通过生物疗法治疗，生物治疗对黑色素瘤有一定的作用，使用患者自身的单核细胞在体外增殖培养，然后将这些细胞返回患者体内，间接激活机体的免疫系统，从而抵抗肿瘤。
