男性感染HPV后早期可能并无明显不适症状，随着疾病的发展，可能会在皮肤上出现良性疣体、尖锐湿疣、男性不育、肿瘤等。
1、无明显症状：有些男性患者在感染HPV后，由于处于早期，即潜伏期，病毒载量小，易被免疫系统清除掉一部分，不会出现明显不适症状，但患者本身携带HPV，也具有传染给他人的可能。
由于患者此时无明显症状，并不认为自己已经感染，也并未做好个人防护，传染给他人的几率较大；
2、皮肤上出现良性疣体：由于感染HPV亚型的不同，可能会出现扁平疣、寻常疣等表现。扁平疣一般是感染HPV3型、10型，寻常疣则是感染HPV2型、4型、7型。表现为隆起于皮肤的米粒样、黄豆样大小的丘疹，质地较硬，有些表面还会比较粗糙，都会随着疾病的发展而不断扩散；
3、尖锐湿疣：尖锐湿疣好发于肛门、生殖器周围等处，早期为形似米粒样大小的小疣体，可能并不会伴有瘙痒、疼痛等明显症状。后期疣体逐渐增大，可能会形成菜花状、鸡冠状的较大赘生物，此时不适症状较明显。严重者可能会蔓延到肛门直肠、尿道内以及面部、口腔内部等，甚至发生破溃、出血。
4、男性不育：精子感染人类乳头瘤病毒是导致男性不育的重要原因之一，所以当男性感染HPV后便有可能出现不育的情况。

5、肿瘤：男性感染高危型HPV后可能还会引起阴茎癌、肛门癌、前列腺癌等恶性肿瘤，还需要引起足够重视。
大多数男性感染后生长的疣体在医生指导下经手术、激光切除后，再进行药物辅助治疗，如阿昔洛韦片、重组人干扰素α2b凝胶等，基本可以达到治愈。