颅脑磁共振平扫是目前检查颅脑疾病最准确、最有效的检查方法，主要可以检查以下疾病：
一、脑血栓，在磁共振上可以表现为比较特征性的改变，确定和血栓疾病有关。
二、脑出血，脑出血在不同时期，磁共振上有特异性的改变，可以确诊为脑出血。
三、脑肿瘤，如果颅内患有原发性肿瘤或者转移性肿瘤，可以在颅脑磁共振平扫上，发现肿瘤的大小、肿瘤的个数以及肿瘤是否压迫脑组织产生水肿以及肿瘤的其他改变。
四、颅内动脉瘤，如果动脉瘤在脑内逐渐增大可以在磁共振平扫上发现有流空样的、圆形的结构，可以发现脑动脉瘤。
五、多发性硬化，也就是脱髓鞘疾病。这种疾病是反复发作的，产生颅内硬化斑，有独特的影像改变。
六、颅内的硬膜下和硬膜外血肿，这种疾病往往是由于头部外伤所引起的硬膜下或者硬膜外血管破裂导致的急性或者慢性的硬膜下或硬膜外血肿，导致压迫颅内脑组织的反应。
七、脑囊虫，脑囊虫疾病可以产生颅内多发性的结节性的改变，可以发现脑囊虫的头节，可以确定是否是脑囊虫。
