输尿管结石的手术，如果是采用开放手术，直接将输尿管切开，利用取石钳将结石直接取出体外，此时取出体外的结石是完整的整体。
如果采用目前微创手术治疗，先使用输尿管镜进入输尿管找到结石以后，利用激光或者超声设备将结石直视下粉末化，将较大的结石在输尿管镜下，用套石篮或者取石钳夹取结石放入膀胱即可，无需直接排除体外。粉末化的结石放入膀胱，后期患者可以自行排尿排出，避免了反复将输尿管镜带出体外，加重输尿管或者加重尿道损伤，同时可以缩短手术的时间，降低患者手术中可能带来的麻醉风险。
但是在碎石的过程中，也有可能粉末化的结石，随着流水而进入肾脏，患者术后可能变成肾脏结石，即便是进入肾脏结石的颗粒也非常微小，手术后4周之内都可以通过排尿的方式自行排除体外。
