伽玛刀治疗垂体瘤的病人，因为相对手术或者其它治疗方式来说，危害很小，相当于是安全无创而有效的治疗方式。有些病人因为肿瘤压迫，垂体瘤的病人本身有肿瘤把正常的垂体压迫以后，正常的垂体功能一般都会受到损伤，所以垂体功能都不正常，再加上有些病人做了手术，手术创伤或者在做伽玛刀以后，射线对正常垂体也有一定放射性损伤，造成患者垂体功能有一定下降。
所以病人的危害主要是造成垂体功能低下以后内分泌紊乱，但是这些病人可以通过内分泌治疗，比如缺哪一种激素必须要用那个激素替代治疗，效果还是很肯定的。另外更少见的危害是射线造成视神经、视通路受损，因为垂体的上方是视神经、视交叉，用伽玛刀治疗因为毕竟是射线，对于肿瘤细胞造成杀灭作用以后，对于正常神经也会有一定照射，所以有些患者在治疗之后有可能会出现视神经受损，造成视力下降、视野缺损情况。
