阿莫西林通常可以治疗肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌等致病菌导致的急性中耳炎，但是对于病毒感染等原因导致的分泌性中耳炎没有效果。为了避免不当用药，建议使用阿莫西林时在医生指导下进行，避免自行用药。
如果是急性中耳炎，通常是肺炎链球菌、溶血性链球菌等致病菌导致，患者可以遵医嘱吃阿莫西林，因为阿莫西林对于以上细菌有抑制作用，可以起到消炎的效果，但前提条件是对阿莫西林不过敏。
在口服阿莫西林的时候，最好同时使用含有抗生素成分的滴耳液滴耳，例如氧氟沙星滴耳液，可以直接作用在鼓膜表面，起到局部消炎作用。
如果是慢性中耳炎急性发作，例如出现耳道流脓、流水、听力下降时，也可以遵医嘱吃阿莫西林控制感染。如果是慢性中耳炎的间歇期，没有急性发作，注意避免感染即可，不需要服用阿莫西林。
此外，如果是分泌性中耳炎，并且是病毒感染导致，患者咽鼓管咽口阻塞，使中耳腔出现负压，中耳腔的分泌物导致中耳炎，如果不是细菌感染引起，吃阿莫西林没有效果，所以不用吃，遵医嘱应用鼻腔喷雾剂、黏液促排剂即可。
耳部闷胀、听力下降、耳道流脓的患者需要及时前往耳鼻喉科就医，一旦确诊为中耳炎，需要根据分型来进行治疗，不是所有患者都适合服用阿莫西林，建议患者遵医嘱用药，不要自行用药。