肛周脓肿即便做了根治术后，还是存在着复发的风险，这是由于疾病的发病特点决定的。肛周脓肿的发病大部分都是因为腺源性感染，肛门齿线以上存在原发性的内口，导致肛周脂肪组织的化脓、感染，局部的脓液越聚越多，压力比较大就会产生剧烈的疼痛。肛周脓肿根治术就是在切开引流的基础上的进一步扩大切开脓腔，尽量找到原发性的内口，把内口切除，对于疾病的治疗比较彻底。
但是即便这样，因为肛周脓肿的化脓期内口不太稳定，医生只是根据经验来寻找内口，但不一定是准确的内口，所以还是存在着复发的风险，另外肛门周围的其他地方也可能出现肛周脓肿这种疾病。
