经期偏头痛的原因有以下几种：
一、因为内分泌系统功能障碍造成的，女性在月经期，体内的激素水平会有较大的变化。雌激素、性激素、孕激素以及黄体生成素等，这些激素的量有些会有较大的上升，而有些会有较大的下降，较大的落差可以引起大脑皮质的感觉功能暂时性的失调，或者由于激素在体内的代谢物质，也可以刺激中枢神经系统，导致女性偏头痛。
二、可能是因为情绪导致的，有些女性在经期会由于情绪方面的波动较大，容易紧张、焦虑或者情绪淡漠，有较多的负面情绪，负面情绪也可以间接地通过神经体液调节，影响到大脑皮质的功能，产生偏头痛的现象。
