智齿不拔不一定有危害，要根据智齿的生长方向和位置判断。如果智齿长出部分方向垂直，且没有肿胀、疼痛感，可以先保留，定期观察。但如果检查全口曲面断层片结果显示智齿生长方向不正，就可能会影响邻牙的生长、对颌的智齿，不拔除可能会产生危害。
歪斜生长的智齿不拔就可能会影响邻牙生长，继而可能会导致牙齿松动，严重时会脱落。还有可能摩擦周围口腔黏膜引发周围组织肿胀、创伤性口腔溃疡。智齿冠周反复炎症导致张口困难、疼痛等问题，严重时可伴随发热等症状。
另外，如果智齿不能完全萌出可能易积存食物残渣，导致细菌堆积，从而引起智齿冠周炎、邻牙龋坏等疾病，所以此类情况也建议尽量拔除。
但也不是所有的智齿都满足可以拔除的条件，如果智齿接近下齿槽神经，强行拔除容易造成神经损伤，影响味觉，有一定的危险性。且患有心脏病、高血压、糖尿病的患者拔智齿容易出现全身并发症，需要根据医生的建议谨慎选择。
