颅骨缺损手术后引起的并发症是否严重，还需要根据实际情况进行判断，可能比较严重也可能不严重，较常见的并发症有以下几种：

1、癫痫：毕竟颅骨修补手术要放置一个颅骨修补材料，而这很容易压迫到周围的正常的脑组织，因此很容易产生异常放电而引起癫痫，所以一定要在手术之前就应用抗癫痫类的药物，这样可以有效降低后期癫痫发生的概率。而就算手术后发作了也是暂时性的，经过口服药物完全可以控制，因此此种并发症并不严重，不必过于担心。由于引发癫痫的常见原因还是因为患者脑外伤所导致的脑损伤引起，只要患者在术前没有这种脑外伤一般很少出现癫痫的并发症，所以手术的安全性还是可以放心的。

2、皮下积液：因为颅骨修补手术之后就改变了颅内正常的压力平衡，这个时候很容易造成这个情况，所以在手术之后一定要定期地复查头部CT，明确相应的病情变化。如果有脑积水的话，及时地进行治疗，可以尽可能地减少患者的损失。

3、脑出血的风险：因为颅骨修补需要将颅脑再次打开，虽然不进入脑子内部，但仍然有可能会造成脑出血的情况，所以这方面一定要在术中仔细操作。

4、颅内感染：手术后颅骨修补材料也可能会造成感染，一旦发生则有可能需要全部拆除，重新再来。