导致肩袖损伤的因素是多方面的，包括退行性变、撞击征、创伤因素、供血原因、脂肪浸润等，肩袖损伤随年龄增长而发病率增高，主要原因是腱性组织退行性变。

　　肩袖位置的特殊性导致软组织间隙较小，极易发生摩擦和撞击现象，久之则出现肩袖的水肿、充血以及变性、撕裂，在组织学上，呈现血供减少，胶原纤维及成纤维细胞数量下降，纤维排列紊乱。研究发现，冈上肌腱靠前1/3部分，距冈上肌止点1cm处，有个“乏血管区”，这一薄弱地带是肌腱附着的中心，甚至有学者认为冈上肌的损伤可能是肩袖损伤的早期表现。随着肌腱变性退变的加重，缺血时间延长，肌腱延展性降低，该区域易受到损伤，一旦冈上肌收缩负荷发生变化，会波及到其它薄弱区域，将引发功能障碍。肩袖活动范围大，氧气消耗大，对血液供应要求也更高，则形成恶性循环，加速疾病进展。

　　肩袖周围存在丰富的感受痛觉和触觉的游离神经末梢，肩袖损伤肌腱张力变化，直接影响关节囊张力和压力方向改变，使关节周围的机械性伤害感受器激活，游离的神经末梢产生痛觉冲动，通过传入纤维，最终作用于大脑痛觉中枢。关节周围张力的变化刺激和局部组织炎症反应，均可引发大量内源性致痛物质的释放，导致疼痛，P物质、血管内皮生长因子、趋化因子CXC家族等均介导了肩袖损伤疼痛机制。