始基子宫的最佳治疗时期是在青春期，也就是12-14岁之间。
在青春期之后可以服用雌激素和孕激素进行相对的序贯治疗，这种治疗方法可以促进子宫发育。但是如果这个始基子宫是没有宫腔和子宫内膜，则属于是痕迹子宫，这种情况治愈的可能较小。即使子宫是在胚胎发育期间双侧的副中肾管在汇合之后不久就停止发育了，这种情况通常合并无阴道症，子宫极小，约1-3厘米，并且没有宫腔和内膜。如果确定子宫没有宫腔和内膜，即便是利用雌孕激素来进行治疗也很难再长出来，也就不会有生育的功能，所以始基子宫的最佳治疗时期是12-14岁之间，且在此期间越早治疗效果越好。
此外，需要注意的是，针对没有子宫内膜和宫腔的始基子宫，即使子宫用药物治疗或是手速治疗是很难起效的。
