肛裂自愈时间需根据肛裂发生时间而定。发病在3个月以内的新鲜肛裂，若注意护理，自行愈合的时间通常为3周左右；陈旧性肛裂通常难以治愈，需要通过手术进行治疗。
新发肛裂裂口较小、较浅，患者通常可使用花椒水坐浴，涂抹马应龙麝香痔疮膏治疗，3周左右可恢复，同时患者应注意清淡饮食，保持大便通畅。当肛裂达到一定严重程度，肛管皮肤一旦损伤，粪便细菌进入皮下正常的黏膜下，局部可出现炎症反应，一旦到达肌层，裂伤不可能痊愈，则无自愈的可能，必须采取药物或手术治疗。
此外，建议肛裂早期的患者日常多摄入新鲜的蔬菜和水果，多饮水，使大便水分充足，起润肠通便的作用，避免便秘。且患者便后必须将肛门冲洗干净，再涂抹消炎的软膏，防止病情进一步加重。
