普通清宫手术有一定的疼痛，但不同患者对疼痛的耐受性不同。通常不会很痛，多数情况下可以忍受，但对疼痛比较敏感者或恐惧疼痛者可行无痛清宫术。
清宫分为普通清宫和无痛清宫，无痛清宫是全程在静脉麻醉下进行，清宫过程中患者没有意识，感觉不到疼痛。而普通清宫仅在清宫前注射止疼针，患者在清宫过程中是意识清楚的，并且可以感觉到疼痛不适。因为每个人对疼痛的耐受力不同，部分人觉得疼痛可以忍受，部分人会觉得疼痛难以忍受。大多数情况下，清宫的疼痛还是可以忍受的。
此外，患者在清宫手术后需注意休息，避免劳累。术后至少休息两周，一月内禁止同房，可淋浴，禁止盆浴。
