舌下囊肿通常无法自愈，患者应首选手术治疗，即将囊肿以及相关腺体一并摘除，基本可达根治效果，可有效预防复发。
舌下囊肿可能为舌下腺囊肿，舌下腺是分泌唾液的腺体，如果舌下腺导管阻塞，分泌的唾液无法正常排出，则会形成舌下腺囊肿。舌下腺囊肿不属于肿瘤，只是唾液淤积形成的局部肿胀。囊肿较大时会影响患者进食，通常无法自愈，需通过手术将囊肿和舌下腺一并摘除。舌下囊肿也有可能是舌腹部的一些小囊肿，通常是黏液腺来源，具有分泌唾液的功能，位于口腔黏膜上。如果其开口阻塞，可形成黏液腺囊肿，需进行手术切除。
舌下囊肿患者在手术治疗后，要保持口腔干净，可以用淡盐水漱口，恢复期以清淡饮食为主，不要吃辛辣、刺激的食物。
