大多数的乳腺囊肿不会自愈，少数的乳腺囊肿在特殊的情况下，可能会有自愈的情况出现。
乳腺发育和退化过程中出现失常会诱发乳腺囊肿，但这种病还达不到疾病的范畴。囊肿的大小也关系到乳腺囊肿是否能够自愈：当乳腺囊肿小于1cm，可以随着时间的推移慢慢减小、消失，达到自愈；乳腺囊肿的体积较大时一般无法自行消失。如果单纯只有囊肿，能够用抽吸术将囊内液体抽取出来，经过多次的抽吸，可使囊肿逐渐变小；某些多发性的积乳囊肿也能够用抽吸术来进行治疗，达到治愈的效果。
乳腺囊肿属于良性的疾病，发生恶性的可能较低，大多数乳腺囊肿患者不需要治疗，以观察和随诊为主，不用过于焦虑担心。患病期间最好定期观察它的形态和大小的变化，若出现明显的变化，应及时到医院就诊、治疗。
