尖锐湿疣的治疗原则是尽可能去除可见的疣体并减少复发，但无论用何种治疗方法，该病的复发总是难免的，一般治疗后6到8个月不复发就达到临床治愈。
外用药物有以下几种，5%足叶草毒素酊，50%的三氯醋酸溶液，5%的咪喹莫特霜或干扰素凝胶等药物。物理治疗有液氮冷冻，二氧化碳激光，电灼等方法。目前较好的可以显著降低复发率的治疗方法是艾拉光动力疗法，采用光敏剂5-氨基酮戊酸外敷于体表面，然后用红光予以局部照射，可以治疗疣体及潜伏感染病灶，大大降低复发率。口服调节免疫的药物有胸腺肽，转移因子，黄芪颗粒，白芍总苷胶囊等。也可以用干扰素100万到300万单位直接注射于疣体的基底部局部封闭治疗。尖锐湿疣主要通过性接触传染，发病期间避免性生活，不与其他人共用毛巾，盆，浴巾等生活用品，患者的内裤用开水洗烫以防交叉感染。
总而言之，尖锐湿疣的治疗是以物理治疗为主，辅助药物治疗，另外个人护理也很重要。
