新生儿脑积水是脑嵴液生成过多或循环吸收障碍，而致脑嵴液在脑室系统或蛛网膜下腔内淤积，并不断增长，压力增高，脑室扩大，即为脑积水。
先天畸形：如中脑导水管狭窄、膈膜形成或闭锁，室间孔闭锁畸形（第四脑室正中孔或侧空闭锁），脑血管畸形，嵴柱裂，小脑扁桃体下疝等。
感染：胎儿宫内感染如各种病毒、原虫和梅毒螺旋体感染性脑膜炎未能及早控制，增生的纤维组织阻塞了脑嵴液的循环孔道，或胎儿颅内炎症也可使脑池、蛛网膜下腔和蛛网膜粘连闭塞。
出血：颅内出血后引起的纤维增生，产伤颅内出血吸收不良等。
肿瘤：可阻塞脑嵴液循环的任何一部分，较多见于第四脑室附近，或脉络丛乳头状瘤。
其他：某些遗传性代谢病、围产期及新生儿窒息、严重的维生素A缺乏等。
