如果自身毛囊损伤，可以通过做好皮肤护理、及时补充营养、适当进行按摩、使用抗生素药物、使用抗真菌药物等方法进行处理，促进疾病恢复。

1、做好皮肤护理：当自身毛囊由于各种原因出现损伤时，还应注意做好护理工作，及时使用清水或温和的清洁产品进行清洗，避免过度牵扯毛发，选择合适的木梳轻轻梳头等。

2、及时补充营养：如果没有及时补充营养可能会影响毛囊生长，此时还应多吃富含蛋白质的食物，例如鸡蛋、牛奶等，还应多吃富含维生素、微量元素的食物等，补充足够的营养，促进毛囊正常发育。

3、适当进行按摩：如果自身毛囊受损，此时可以适当使用双手轻轻按摩头皮或其他部位的皮肤，可以促进局部血液循环，从而可以促进毛囊恢复，生长毛发。

4、使用抗生素药物：如果自身存在毛囊炎，炎症因子可能会对毛囊产生一定影响，还应在医生的帮助下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。

5、使用抗真菌药物：如果自身存在真菌感染，也会影响毛囊的健康，此时可以听从医生的建议使用盐酸特比萘芬凝胶、酮康唑乳膏等药物。

此外，还可以在医生的指导下使用糖皮质激素药物、促进毛发生长药物、促进细胞增殖药物等，或进行毛囊移植手术。但是应该注意，如果是外伤导致的毛囊损伤，此时毛囊大多完全坏死，并不能恢复如初。